Sikkerheten rundt bruk av hydrogen er også et aktuelt tema. Spørsmålet er hvor farlig det er å oppbevare og utnytte gassen. Hvis det skulle forekomme en lekkasje av hydrogen vil det dannes en lett antennelig forbindelse når gassen blandes med luft, som fort kan ende i eksplosjon. Denne forbindelsen kalles knallgassblanding. Den regnes likevel ikke for å være farligere enn bensin, og det er ikke stor risiko ved å bruke gassen ute. Det er fordi hydrogen er så lett at den vil stige fort til værs.
